Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIA4P48058 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIA4P48058 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIA4P48058 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIA4P48058 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIA4P48058 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIA4P48058 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIA4P48058 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIA4P48058 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIA4P48058 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIA4P48058 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIA4P48058 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIA4P48058 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIA4P48058 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIA4P48058 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIA4P48058 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIA4P48058 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIA4P48058 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIA4P48058 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIA4P48058 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIA4P48058 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIA4P48058 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIA4P48058 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIA4P48058 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIA4P48058 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIA4P48058 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIA4P48058 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIA4P48058 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIA4P48058 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIA4P48058 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIA4P48058 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIA4P48058 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIA4P48058 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIA4P48058 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIA4P48058 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms