Protein–RNA interactions for Protein: P47804

RGR, RPE-retinal G protein-coupled receptor, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGRP47804 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RGRP47804 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGRP47804 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGRP47804 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGRP47804 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGRP47804 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGRP47804 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGRP47804 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGRP47804 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGRP47804 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGRP47804 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGRP47804 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGRP47804 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGRP47804 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGRP47804 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGRP47804 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RGRP47804 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGRP47804 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RGRP47804 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGRP47804 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGRP47804 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGRP47804 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGRP47804 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGRP47804 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGRP47804 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGRP47804 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGRP47804 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGRP47804 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGRP47804 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGRP47804 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGRP47804 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGRP47804 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGRP47804 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RGRP47804 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGRP47804 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGRP47804 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGRP47804 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGRP47804 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGRP47804 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGRP47804 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGRP47804 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGRP47804 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGRP47804 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGRP47804 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGRP47804 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGRP47804 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RGRP47804 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGRP47804 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGRP47804 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGRP47804 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGRP47804 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGRP47804 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGRP47804 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGRP47804 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGRP47804 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGRP47804 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGRP47804 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGRP47804 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGRP47804 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGRP47804 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGRP47804 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RGRP47804 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGRP47804 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGRP47804 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGRP47804 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGRP47804 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGRP47804 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RGRP47804 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGRP47804 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGRP47804 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGRP47804 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGRP47804 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGRP47804 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGRP47804 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGRP47804 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGRP47804 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGRP47804 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGRP47804 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RGRP47804 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGRP47804 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGRP47804 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGRP47804 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGRP47804 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGRP47804 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGRP47804 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGRP47804 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGRP47804 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGRP47804 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGRP47804 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGRP47804 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGRP47804 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGRP47804 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGRP47804 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGRP47804 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGRP47804 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGRP47804 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGRP47804 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGRP47804 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGRP47804 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGRP47804 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms