Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEDD4P46934 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEDD4P46934 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEDD4P46934 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NEDD4P46934 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEDD4P46934 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEDD4P46934 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEDD4P46934 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEDD4P46934 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEDD4P46934 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEDD4P46934 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEDD4P46934 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEDD4P46934 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEDD4P46934 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEDD4P46934 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEDD4P46934 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEDD4P46934 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEDD4P46934 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEDD4P46934 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEDD4P46934 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEDD4P46934 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEDD4P46934 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEDD4P46934 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEDD4P46934 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEDD4P46934 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEDD4P46934 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEDD4P46934 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEDD4P46934 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEDD4P46934 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEDD4P46934 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEDD4P46934 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEDD4P46934 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEDD4P46934 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEDD4P46934 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEDD4P46934 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEDD4P46934 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEDD4P46934 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NEDD4P46934 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NEDD4P46934 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEDD4P46934 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEDD4P46934 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEDD4P46934 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEDD4P46934 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEDD4P46934 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEDD4P46934 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEDD4P46934 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEDD4P46934 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEDD4P46934 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEDD4P46934 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEDD4P46934 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NEDD4P46934 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEDD4P46934 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEDD4P46934 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NEDD4P46934 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEDD4P46934 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEDD4P46934 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEDD4P46934 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEDD4P46934 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEDD4P46934 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEDD4P46934 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEDD4P46934 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEDD4P46934 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NEDD4P46934 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NEDD4P46934 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NEDD4P46934 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEDD4P46934 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms