Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GNPDA1P46926 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GNPDA1P46926 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GNPDA1P46926 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GNPDA1P46926 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GNPDA1P46926 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GNPDA1P46926 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GNPDA1P46926 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GNPDA1P46926 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GNPDA1P46926 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GNPDA1P46926 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GNPDA1P46926 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNPDA1P46926 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNPDA1P46926 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNPDA1P46926 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNPDA1P46926 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNPDA1P46926 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNPDA1P46926 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNPDA1P46926 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNPDA1P46926 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GNPDA1P46926 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNPDA1P46926 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNPDA1P46926 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GNPDA1P46926 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GNPDA1P46926 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GNPDA1P46926 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GNPDA1P46926 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GNPDA1P46926 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GNPDA1P46926 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GNPDA1P46926 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GNPDA1P46926 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNPDA1P46926 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms