Protein–RNA interactions for Protein: P46108

CRK, Adapter molecule crk, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRKP46108 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CRKP46108 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CRKP46108 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CRKP46108 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CRKP46108 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CRKP46108 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CRKP46108 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CRKP46108 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CRKP46108 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CRKP46108 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CRKP46108 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CRKP46108 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CRKP46108 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CRKP46108 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CRKP46108 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CRKP46108 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CRKP46108 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CRKP46108 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CRKP46108 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CRKP46108 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CRKP46108 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CRKP46108 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CRKP46108 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CRKP46108 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CRKP46108 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CRKP46108 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CRKP46108 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CRKP46108 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CRKP46108 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CRKP46108 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CRKP46108 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRKP46108 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRKP46108 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CRKP46108 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CRKP46108 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CRKP46108 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CRKP46108 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CRKP46108 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CRKP46108 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CRKP46108 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CRKP46108 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CRKP46108 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CRKP46108 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CRKP46108 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CRKP46108 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CRKP46108 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CRKP46108 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CRKP46108 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CRKP46108 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CRKP46108 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CRKP46108 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CRKP46108 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CRKP46108 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CRKP46108 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CRKP46108 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CRKP46108 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CRKP46108 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CRKP46108 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CRKP46108 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CRKP46108 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CRKP46108 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CRKP46108 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CRKP46108 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRKP46108 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRKP46108 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRKP46108 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRKP46108 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRKP46108 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRKP46108 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRKP46108 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRKP46108 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CRKP46108 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRKP46108 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CRKP46108 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRKP46108 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRKP46108 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CRKP46108 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRKP46108 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRKP46108 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRKP46108 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CRKP46108 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CRKP46108 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CRKP46108 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CRKP46108 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CRKP46108 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRKP46108 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRKP46108 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRKP46108 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CRKP46108 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRKP46108 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRKP46108 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRKP46108 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRKP46108 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRKP46108 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRKP46108 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRKP46108 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRKP46108 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRKP46108 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRKP46108 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRKP46108 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms