Protein–RNA interactions for Protein: P46013

MKI67, Proliferation marker protein Ki-67, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKI67P46013 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MKI67P46013 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MKI67P46013 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MKI67P46013 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MKI67P46013 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MKI67P46013 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MKI67P46013 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MKI67P46013 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MKI67P46013 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MKI67P46013 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MKI67P46013 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MKI67P46013 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MKI67P46013 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MKI67P46013 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MKI67P46013 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MKI67P46013 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MKI67P46013 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MKI67P46013 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MKI67P46013 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MKI67P46013 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MKI67P46013 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MKI67P46013 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MKI67P46013 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MKI67P46013 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MKI67P46013 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MKI67P46013 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MKI67P46013 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MKI67P46013 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MKI67P46013 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MKI67P46013 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MKI67P46013 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MKI67P46013 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MKI67P46013 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MKI67P46013 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MKI67P46013 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MKI67P46013 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MKI67P46013 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MKI67P46013 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MKI67P46013 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MKI67P46013 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MKI67P46013 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MKI67P46013 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MKI67P46013 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MKI67P46013 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
MKI67P46013 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MKI67P46013 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MKI67P46013 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MKI67P46013 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MKI67P46013 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MKI67P46013 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MKI67P46013 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MKI67P46013 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MKI67P46013 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MKI67P46013 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MKI67P46013 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MKI67P46013 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MKI67P46013 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MKI67P46013 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MKI67P46013 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MKI67P46013 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MKI67P46013 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MKI67P46013 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MKI67P46013 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MKI67P46013 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MKI67P46013 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MKI67P46013 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MKI67P46013 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MKI67P46013 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MKI67P46013 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MKI67P46013 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MKI67P46013 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MKI67P46013 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MKI67P46013 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MKI67P46013 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MKI67P46013 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MKI67P46013 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MKI67P46013 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MKI67P46013 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
MKI67P46013 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MKI67P46013 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MKI67P46013 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MKI67P46013 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MKI67P46013 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MKI67P46013 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKI67P46013 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKI67P46013 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKI67P46013 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKI67P46013 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKI67P46013 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MKI67P46013 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MKI67P46013 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MKI67P46013 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MKI67P46013 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MKI67P46013 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MKI67P46013 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MKI67P46013 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MKI67P46013 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MKI67P46013 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MKI67P46013 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MKI67P46013 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms