Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSMC4P43686 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSMC4P43686 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSMC4P43686 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PSMC4P43686 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMC4P43686 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMC4P43686 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMC4P43686 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMC4P43686 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMC4P43686 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMC4P43686 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSMC4P43686 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSMC4P43686 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSMC4P43686 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSMC4P43686 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSMC4P43686 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSMC4P43686 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMC4P43686 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMC4P43686 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMC4P43686 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMC4P43686 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMC4P43686 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMC4P43686 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMC4P43686 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PSMC4P43686 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMC4P43686 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMC4P43686 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMC4P43686 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMC4P43686 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMC4P43686 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMC4P43686 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMC4P43686 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMC4P43686 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMC4P43686 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMC4P43686 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMC4P43686 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMC4P43686 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMC4P43686 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMC4P43686 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMC4P43686 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMC4P43686 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMC4P43686 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMC4P43686 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMC4P43686 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMC4P43686 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMC4P43686 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMC4P43686 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMC4P43686 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMC4P43686 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMC4P43686 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMC4P43686 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMC4P43686 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSMC4P43686 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSMC4P43686 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PSMC4P43686 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSMC4P43686 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMC4P43686 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMC4P43686 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMC4P43686 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMC4P43686 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms