Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PI4KAP42356 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PI4KAP42356 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PI4KAP42356 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PI4KAP42356 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PI4KAP42356 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PI4KAP42356 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PI4KAP42356 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PI4KAP42356 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PI4KAP42356 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PI4KAP42356 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PI4KAP42356 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PI4KAP42356 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PI4KAP42356 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PI4KAP42356 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PI4KAP42356 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PI4KAP42356 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PI4KAP42356 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PI4KAP42356 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PI4KAP42356 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PI4KAP42356 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PI4KAP42356 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PI4KAP42356 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PI4KAP42356 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PI4KAP42356 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PI4KAP42356 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PI4KAP42356 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms