Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3CBP42338 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CBP42338 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CBP42338 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms