Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFC5P40937 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFC5P40937 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFC5P40937 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFC5P40937 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFC5P40937 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFC5P40937 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFC5P40937 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFC5P40937 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFC5P40937 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFC5P40937 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFC5P40937 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFC5P40937 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RFC5P40937 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFC5P40937 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RFC5P40937 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RFC5P40937 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFC5P40937 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFC5P40937 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFC5P40937 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFC5P40937 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFC5P40937 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFC5P40937 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFC5P40937 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFC5P40937 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFC5P40937 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFC5P40937 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RFC5P40937 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFC5P40937 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFC5P40937 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFC5P40937 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFC5P40937 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFC5P40937 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFC5P40937 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFC5P40937 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFC5P40937 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFC5P40937 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFC5P40937 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFC5P40937 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFC5P40937 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFC5P40937 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RFC5P40937 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RFC5P40937 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RFC5P40937 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RFC5P40937 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RFC5P40937 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RFC5P40937 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RFC5P40937 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RFC5P40937 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RFC5P40937 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RFC5P40937 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RFC5P40937 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RFC5P40937 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFC5P40937 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFC5P40937 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFC5P40937 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFC5P40937 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFC5P40937 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFC5P40937 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RFC5P40937 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RFC5P40937 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RFC5P40937 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RFC5P40937 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RFC5P40937 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RFC5P40937 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RFC5P40937 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RFC5P40937 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RFC5P40937 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RFC5P40937 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RFC5P40937 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RFC5P40937 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RFC5P40937 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RFC5P40937 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RFC5P40937 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RFC5P40937 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RFC5P40937 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RFC5P40937 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RFC5P40937 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFC5P40937 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFC5P40937 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFC5P40937 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFC5P40937 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFC5P40937 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFC5P40937 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFC5P40937 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFC5P40937 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFC5P40937 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFC5P40937 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFC5P40937 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFC5P40937 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RFC5P40937 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RFC5P40937 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RFC5P40937 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFC5P40937 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFC5P40937 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFC5P40937 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFC5P40937 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFC5P40937 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFC5P40937 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFC5P40937 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms