Protein–RNA interactions for Protein: P40305

IFI27, Interferon alpha-inducible protein 27, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI27P40305 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFI27P40305 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFI27P40305 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFI27P40305 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFI27P40305 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFI27P40305 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFI27P40305 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFI27P40305 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFI27P40305 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFI27P40305 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFI27P40305 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFI27P40305 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFI27P40305 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFI27P40305 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFI27P40305 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFI27P40305 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFI27P40305 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFI27P40305 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFI27P40305 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFI27P40305 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFI27P40305 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFI27P40305 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFI27P40305 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFI27P40305 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFI27P40305 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
IFI27P40305 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
IFI27P40305 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFI27P40305 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFI27P40305 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFI27P40305 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFI27P40305 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFI27P40305 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFI27P40305 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFI27P40305 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFI27P40305 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFI27P40305 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFI27P40305 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFI27P40305 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFI27P40305 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFI27P40305 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFI27P40305 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFI27P40305 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFI27P40305 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFI27P40305 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IFI27P40305 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFI27P40305 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFI27P40305 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFI27P40305 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFI27P40305 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFI27P40305 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFI27P40305 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFI27P40305 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFI27P40305 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFI27P40305 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFI27P40305 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFI27P40305 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFI27P40305 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFI27P40305 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFI27P40305 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFI27P40305 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFI27P40305 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFI27P40305 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFI27P40305 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IFI27P40305 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFI27P40305 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFI27P40305 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFI27P40305 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFI27P40305 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFI27P40305 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFI27P40305 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFI27P40305 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFI27P40305 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFI27P40305 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFI27P40305 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFI27P40305 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFI27P40305 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFI27P40305 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFI27P40305 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFI27P40305 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFI27P40305 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFI27P40305 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFI27P40305 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFI27P40305 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFI27P40305 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFI27P40305 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFI27P40305 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFI27P40305 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IFI27P40305 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFI27P40305 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFI27P40305 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFI27P40305 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFI27P40305 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFI27P40305 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFI27P40305 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFI27P40305 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFI27P40305 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFI27P40305 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFI27P40305 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFI27P40305 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFI27P40305 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms