Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
THPOP40225 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
THPOP40225 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
THPOP40225 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
THPOP40225 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
THPOP40225 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
THPOP40225 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
THPOP40225 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
THPOP40225 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
THPOP40225 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
THPOP40225 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
THPOP40225 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
THPOP40225 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
THPOP40225 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
THPOP40225 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
THPOP40225 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
THPOP40225 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
THPOP40225 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
THPOP40225 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
THPOP40225 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
THPOP40225 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
THPOP40225 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
THPOP40225 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
THPOP40225 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
THPOP40225 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
THPOP40225 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
THPOP40225 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
THPOP40225 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
THPOP40225 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
THPOP40225 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
THPOP40225 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
THPOP40225 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
THPOP40225 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
THPOP40225 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
THPOP40225 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
THPOP40225 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
THPOP40225 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
THPOP40225 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
THPOP40225 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
THPOP40225 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
THPOP40225 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
THPOP40225 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
THPOP40225 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
THPOP40225 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
THPOP40225 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
THPOP40225 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
THPOP40225 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
THPOP40225 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
THPOP40225 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
THPOP40225 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
THPOP40225 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
THPOP40225 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
THPOP40225 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
THPOP40225 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
THPOP40225 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
THPOP40225 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
THPOP40225 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
THPOP40225 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
THPOP40225 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
THPOP40225 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
THPOP40225 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
THPOP40225 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
THPOP40225 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
THPOP40225 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
THPOP40225 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
THPOP40225 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
THPOP40225 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
THPOP40225 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
THPOP40225 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
THPOP40225 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
THPOP40225 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
THPOP40225 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
THPOP40225 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
THPOP40225 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
THPOP40225 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
THPOP40225 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
THPOP40225 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
THPOP40225 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
THPOP40225 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
THPOP40225 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
THPOP40225 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
THPOP40225 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
THPOP40225 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
THPOP40225 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
THPOP40225 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
THPOP40225 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
THPOP40225 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
THPOP40225 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
THPOP40225 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
THPOP40225 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
THPOP40225 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
THPOP40225 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
THPOP40225 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
THPOP40225 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
THPOP40225 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
THPOP40225 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
THPOP40225 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
THPOP40225 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
THPOP40225 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
THPOP40225 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.7 ms