Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HSPA9P38646 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HSPA9P38646 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HSPA9P38646 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HSPA9P38646 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HSPA9P38646 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HSPA9P38646 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HSPA9P38646 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HSPA9P38646 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HSPA9P38646 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HSPA9P38646 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HSPA9P38646 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSPA9P38646 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSPA9P38646 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSPA9P38646 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSPA9P38646 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSPA9P38646 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSPA9P38646 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSPA9P38646 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSPA9P38646 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSPA9P38646 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSPA9P38646 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSPA9P38646 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSPA9P38646 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSPA9P38646 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSPA9P38646 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSPA9P38646 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HSPA9P38646 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HSPA9P38646 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSPA9P38646 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSPA9P38646 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSPA9P38646 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSPA9P38646 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSPA9P38646 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSPA9P38646 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HSPA9P38646 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSPA9P38646 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSPA9P38646 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSPA9P38646 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSPA9P38646 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSPA9P38646 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSPA9P38646 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSPA9P38646 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSPA9P38646 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSPA9P38646 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSPA9P38646 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSPA9P38646 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSPA9P38646 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSPA9P38646 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSPA9P38646 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSPA9P38646 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSPA9P38646 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSPA9P38646 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSPA9P38646 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSPA9P38646 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSPA9P38646 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSPA9P38646 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSPA9P38646 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSPA9P38646 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSPA9P38646 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSPA9P38646 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms