Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ETFBP38117 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ETFBP38117 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ETFBP38117 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ETFBP38117 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ETFBP38117 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ETFBP38117 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ETFBP38117 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ETFBP38117 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ETFBP38117 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ETFBP38117 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ETFBP38117 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
ETFBP38117 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ETFBP38117 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ETFBP38117 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ETFBP38117 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ETFBP38117 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ETFBP38117 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ETFBP38117 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ETFBP38117 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ETFBP38117 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ETFBP38117 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ETFBP38117 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ETFBP38117 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ETFBP38117 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ETFBP38117 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ETFBP38117 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ETFBP38117 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ETFBP38117 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ETFBP38117 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ETFBP38117 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ETFBP38117 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ETFBP38117 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ETFBP38117 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ETFBP38117 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ETFBP38117 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ETFBP38117 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ETFBP38117 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ETFBP38117 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ETFBP38117 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ETFBP38117 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ETFBP38117 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ETFBP38117 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ETFBP38117 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ETFBP38117 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ETFBP38117 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ETFBP38117 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ETFBP38117 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ETFBP38117 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ETFBP38117 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ETFBP38117 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ETFBP38117 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ETFBP38117 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ETFBP38117 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ETFBP38117 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ETFBP38117 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ETFBP38117 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ETFBP38117 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ETFBP38117 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ETFBP38117 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ETFBP38117 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ETFBP38117 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ETFBP38117 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ETFBP38117 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ETFBP38117 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ETFBP38117 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ETFBP38117 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ETFBP38117 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ETFBP38117 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ETFBP38117 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ETFBP38117 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ETFBP38117 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ETFBP38117 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ETFBP38117 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ETFBP38117 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ETFBP38117 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ETFBP38117 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ETFBP38117 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ETFBP38117 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ETFBP38117 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ETFBP38117 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ETFBP38117 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ETFBP38117 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ETFBP38117 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ETFBP38117 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ETFBP38117 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ETFBP38117 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ETFBP38117 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ETFBP38117 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ETFBP38117 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ETFBP38117 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ETFBP38117 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ETFBP38117 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ETFBP38117 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ETFBP38117 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ETFBP38117 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ETFBP38117 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ETFBP38117 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ETFBP38117 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ETFBP38117 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.2 ms