Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPARGP37231 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPARGP37231 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPARGP37231 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPARGP37231 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPARGP37231 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPARGP37231 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPARGP37231 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPARGP37231 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPARGP37231 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPARGP37231 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPARGP37231 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPARGP37231 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPARGP37231 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPARGP37231 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPARGP37231 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPARGP37231 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPARGP37231 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPARGP37231 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPARGP37231 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPARGP37231 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPARGP37231 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPARGP37231 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPARGP37231 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPARGP37231 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPARGP37231 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PPARGP37231 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPARGP37231 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPARGP37231 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PPARGP37231 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPARGP37231 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPARGP37231 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPARGP37231 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPARGP37231 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PPARGP37231 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPARGP37231 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPARGP37231 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPARGP37231 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPARGP37231 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPARGP37231 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPARGP37231 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PPARGP37231 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPARGP37231 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPARGP37231 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPARGP37231 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPARGP37231 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPARGP37231 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPARGP37231 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPARGP37231 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPARGP37231 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPARGP37231 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPARGP37231 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPARGP37231 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPARGP37231 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPARGP37231 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPARGP37231 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPARGP37231 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPARGP37231 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPARGP37231 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPARGP37231 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPARGP37231 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPARGP37231 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPARGP37231 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPARGP37231 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPARGP37231 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPARGP37231 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPARGP37231 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPARGP37231 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPARGP37231 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPARGP37231 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPARGP37231 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPARGP37231 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPARGP37231 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPARGP37231 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPARGP37231 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPARGP37231 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPARGP37231 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPARGP37231 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPARGP37231 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPARGP37231 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PPARGP37231 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPARGP37231 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPARGP37231 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPARGP37231 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPARGP37231 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPARGP37231 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPARGP37231 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPARGP37231 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPARGP37231 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPARGP37231 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPARGP37231 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPARGP37231 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPARGP37231 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPARGP37231 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPARGP37231 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPARGP37231 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPARGP37231 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPARGP37231 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPARGP37231 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPARGP37231 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms