Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYH11P35749 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYH11P35749 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYH11P35749 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYH11P35749 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYH11P35749 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYH11P35749 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MYH11P35749 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYH11P35749 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYH11P35749 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYH11P35749 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MYH11P35749 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYH11P35749 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MYH11P35749 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYH11P35749 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MYH11P35749 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYH11P35749 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYH11P35749 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYH11P35749 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYH11P35749 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYH11P35749 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYH11P35749 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYH11P35749 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYH11P35749 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYH11P35749 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYH11P35749 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MYH11P35749 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYH11P35749 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYH11P35749 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYH11P35749 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYH11P35749 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYH11P35749 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYH11P35749 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYH11P35749 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYH11P35749 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYH11P35749 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYH11P35749 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYH11P35749 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MYH11P35749 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYH11P35749 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYH11P35749 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYH11P35749 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYH11P35749 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYH11P35749 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYH11P35749 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYH11P35749 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYH11P35749 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYH11P35749 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYH11P35749 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYH11P35749 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYH11P35749 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYH11P35749 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYH11P35749 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYH11P35749 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYH11P35749 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYH11P35749 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYH11P35749 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYH11P35749 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MYH11P35749 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYH11P35749 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MYH11P35749 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MYH11P35749 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYH11P35749 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYH11P35749 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYH11P35749 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYH11P35749 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MYH11P35749 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYH11P35749 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MYH11P35749 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYH11P35749 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYH11P35749 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MYH11P35749 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYH11P35749 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYH11P35749 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYH11P35749 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYH11P35749 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYH11P35749 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYH11P35749 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYH11P35749 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYH11P35749 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYH11P35749 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYH11P35749 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYH11P35749 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYH11P35749 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYH11P35749 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYH11P35749 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYH11P35749 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MYH11P35749 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYH11P35749 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYH11P35749 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYH11P35749 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYH11P35749 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MYH11P35749 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MYH11P35749 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYH11P35749 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYH11P35749 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYH11P35749 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYH11P35749 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYH11P35749 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYH11P35749 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms