Protein–RNA interactions for Protein: P35680

HNF1B, Hepatocyte nuclear factor 1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1BP35680 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HNF1BP35680 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HNF1BP35680 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HNF1BP35680 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HNF1BP35680 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HNF1BP35680 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HNF1BP35680 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HNF1BP35680 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HNF1BP35680 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HNF1BP35680 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HNF1BP35680 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HNF1BP35680 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HNF1BP35680 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HNF1BP35680 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HNF1BP35680 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HNF1BP35680 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HNF1BP35680 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HNF1BP35680 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HNF1BP35680 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HNF1BP35680 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HNF1BP35680 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HNF1BP35680 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HNF1BP35680 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HNF1BP35680 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HNF1BP35680 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HNF1BP35680 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HNF1BP35680 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HNF1BP35680 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HNF1BP35680 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HNF1BP35680 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HNF1BP35680 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms