Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTN2P35609 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTN2P35609 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTN2P35609 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTN2P35609 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms