Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA4P35212 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA4P35212 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA4P35212 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA4P35212 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA4P35212 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA4P35212 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA4P35212 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA4P35212 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA4P35212 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA4P35212 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA4P35212 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA4P35212 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA4P35212 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA4P35212 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA4P35212 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA4P35212 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA4P35212 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA4P35212 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA4P35212 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA4P35212 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA4P35212 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA4P35212 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA4P35212 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA4P35212 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA4P35212 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA4P35212 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJA4P35212 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA4P35212 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA4P35212 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA4P35212 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA4P35212 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA4P35212 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA4P35212 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA4P35212 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA4P35212 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA4P35212 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GJA4P35212 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GJA4P35212 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJA4P35212 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJA4P35212 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GJA4P35212 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA4P35212 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA4P35212 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA4P35212 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA4P35212 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA4P35212 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA4P35212 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA4P35212 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA4P35212 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA4P35212 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA4P35212 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA4P35212 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA4P35212 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA4P35212 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA4P35212 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA4P35212 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA4P35212 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA4P35212 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA4P35212 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA4P35212 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA4P35212 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GJA4P35212 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA4P35212 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA4P35212 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA4P35212 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA4P35212 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA4P35212 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA4P35212 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA4P35212 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA4P35212 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA4P35212 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA4P35212 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA4P35212 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA4P35212 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA4P35212 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA4P35212 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA4P35212 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA4P35212 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA4P35212 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA4P35212 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA4P35212 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA4P35212 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA4P35212 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA4P35212 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA4P35212 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA4P35212 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA4P35212 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA4P35212 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA4P35212 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA4P35212 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA4P35212 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA4P35212 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA4P35212 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA4P35212 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA4P35212 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA4P35212 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA4P35212 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA4P35212 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA4P35212 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms