Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DSG3P32926 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DSG3P32926 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DSG3P32926 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DSG3P32926 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DSG3P32926 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DSG3P32926 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DSG3P32926 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DSG3P32926 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DSG3P32926 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
DSG3P32926 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DSG3P32926 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DSG3P32926 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DSG3P32926 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DSG3P32926 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DSG3P32926 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DSG3P32926 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DSG3P32926 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DSG3P32926 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DSG3P32926 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DSG3P32926 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DSG3P32926 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DSG3P32926 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DSG3P32926 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DSG3P32926 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DSG3P32926 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DSG3P32926 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DSG3P32926 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DSG3P32926 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DSG3P32926 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DSG3P32926 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DSG3P32926 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DSG3P32926 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DSG3P32926 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DSG3P32926 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DSG3P32926 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DSG3P32926 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DSG3P32926 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DSG3P32926 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DSG3P32926 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
DSG3P32926 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DSG3P32926 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DSG3P32926 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DSG3P32926 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DSG3P32926 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DSG3P32926 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DSG3P32926 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DSG3P32926 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DSG3P32926 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DSG3P32926 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DSG3P32926 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DSG3P32926 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DSG3P32926 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DSG3P32926 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DSG3P32926 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DSG3P32926 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DSG3P32926 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DSG3P32926 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DSG3P32926 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DSG3P32926 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DSG3P32926 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
DSG3P32926 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DSG3P32926 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DSG3P32926 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DSG3P32926 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DSG3P32926 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DSG3P32926 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DSG3P32926 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DSG3P32926 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DSG3P32926 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DSG3P32926 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DSG3P32926 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DSG3P32926 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
DSG3P32926 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DSG3P32926 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DSG3P32926 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DSG3P32926 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DSG3P32926 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
DSG3P32926 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DSG3P32926 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DSG3P32926 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DSG3P32926 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DSG3P32926 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DSG3P32926 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DSG3P32926 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DSG3P32926 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
DSG3P32926 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DSG3P32926 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DSG3P32926 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DSG3P32926 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DSG3P32926 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DSG3P32926 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DSG3P32926 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
DSG3P32926 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DSG3P32926 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DSG3P32926 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DSG3P32926 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DSG3P32926 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DSG3P32926 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DSG3P32926 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms