Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXC8P31273 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXC8P31273 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXC8P31273 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXC8P31273 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXC8P31273 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXC8P31273 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXC8P31273 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXC8P31273 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXC8P31273 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXC8P31273 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXC8P31273 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXC8P31273 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXC8P31273 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXC8P31273 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXC8P31273 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXC8P31273 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXC8P31273 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXC8P31273 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXC8P31273 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXC8P31273 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXC8P31273 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXC8P31273 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXC8P31273 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXC8P31273 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXC8P31273 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXC8P31273 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXC8P31273 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXC8P31273 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXC8P31273 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HOXC8P31273 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXC8P31273 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms