Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRB3P28472 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRB3P28472 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRB3P28472 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRB3P28472 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRB3P28472 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRB3P28472 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRB3P28472 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRB3P28472 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRB3P28472 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRB3P28472 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRB3P28472 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRB3P28472 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRB3P28472 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRB3P28472 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRB3P28472 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRB3P28472 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRB3P28472 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRB3P28472 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRB3P28472 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRB3P28472 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRB3P28472 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRB3P28472 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRB3P28472 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRB3P28472 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRB3P28472 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRB3P28472 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRB3P28472 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRB3P28472 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRB3P28472 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRB3P28472 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRB3P28472 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRB3P28472 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRB3P28472 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRB3P28472 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRB3P28472 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRB3P28472 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRB3P28472 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRB3P28472 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRB3P28472 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRB3P28472 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRB3P28472 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRB3P28472 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRB3P28472 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRB3P28472 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRB3P28472 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRB3P28472 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRB3P28472 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRB3P28472 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRB3P28472 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GABRB3P28472 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRB3P28472 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRB3P28472 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRB3P28472 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRB3P28472 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRB3P28472 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRB3P28472 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRB3P28472 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRB3P28472 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRB3P28472 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRB3P28472 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRB3P28472 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRB3P28472 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRB3P28472 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRB3P28472 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRB3P28472 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRB3P28472 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRB3P28472 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRB3P28472 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRB3P28472 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRB3P28472 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRB3P28472 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRB3P28472 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRB3P28472 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRB3P28472 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRB3P28472 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRB3P28472 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRB3P28472 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRB3P28472 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRB3P28472 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRB3P28472 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms