Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
HMGB2P26583 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
HMGB2P26583 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
HMGB2P26583 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HMGB2P26583 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HMGB2P26583 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
HMGB2P26583 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HMGB2P26583 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
HMGB2P26583 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
HMGB2P26583 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HMGB2P26583 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HMGB2P26583 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
HMGB2P26583 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
HMGB2P26583 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
HMGB2P26583 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
HMGB2P26583 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
HMGB2P26583 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
HMGB2P26583 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
HMGB2P26583 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
HMGB2P26583 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
HMGB2P26583 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
HMGB2P26583 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
HMGB2P26583 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
HMGB2P26583 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
HMGB2P26583 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
HMGB2P26583 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
HMGB2P26583 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
HMGB2P26583 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
HMGB2P26583 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
HMGB2P26583 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
HMGB2P26583 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
HMGB2P26583 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
HMGB2P26583 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
HMGB2P26583 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HMGB2P26583 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
HMGB2P26583 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
HMGB2P26583 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HMGB2P26583 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HMGB2P26583 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HMGB2P26583 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
HMGB2P26583 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HMGB2P26583 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
HMGB2P26583 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
HMGB2P26583 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HMGB2P26583 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HMGB2P26583 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
HMGB2P26583 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HMGB2P26583 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
HMGB2P26583 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
HMGB2P26583 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HMGB2P26583 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
HMGB2P26583 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HMGB2P26583 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HMGB2P26583 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HMGB2P26583 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
HMGB2P26583 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
HMGB2P26583 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
HMGB2P26583 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HMGB2P26583 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HMGB2P26583 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HMGB2P26583 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HMGB2P26583 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HMGB2P26583 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
HMGB2P26583 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
HMGB2P26583 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
HMGB2P26583 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HMGB2P26583 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HMGB2P26583 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HMGB2P26583 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HMGB2P26583 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
HMGB2P26583 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
HMGB2P26583 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HMGB2P26583 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HMGB2P26583 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HMGB2P26583 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HMGB2P26583 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
HMGB2P26583 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
HMGB2P26583 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
HMGB2P26583 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
HMGB2P26583 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
HMGB2P26583 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
HMGB2P26583 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
HMGB2P26583 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
HMGB2P26583 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
HMGB2P26583 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
HMGB2P26583 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
HMGB2P26583 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
HMGB2P26583 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
HMGB2P26583 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC31.26■■■□□ 2.59
HMGB2P26583 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
HMGB2P26583 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
HMGB2P26583 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
HMGB2P26583 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
HMGB2P26583 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
HMGB2P26583 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HMGB2P26583 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HMGB2P26583 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HMGB2P26583 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC31.24■■■□□ 2.59
HMGB2P26583 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
HMGB2P26583 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms