Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BCKDHBP21953 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCKDHBP21953 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BCKDHBP21953 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCKDHBP21953 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCKDHBP21953 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCKDHBP21953 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCKDHBP21953 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCKDHBP21953 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCKDHBP21953 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCKDHBP21953 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCKDHBP21953 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCKDHBP21953 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCKDHBP21953 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCKDHBP21953 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCKDHBP21953 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCKDHBP21953 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCKDHBP21953 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCKDHBP21953 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCKDHBP21953 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCKDHBP21953 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCKDHBP21953 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCKDHBP21953 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BCKDHBP21953 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCKDHBP21953 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCKDHBP21953 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCKDHBP21953 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms