Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MATN1P21941 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MATN1P21941 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MATN1P21941 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MATN1P21941 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MATN1P21941 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MATN1P21941 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MATN1P21941 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MATN1P21941 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MATN1P21941 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MATN1P21941 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MATN1P21941 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MATN1P21941 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MATN1P21941 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MATN1P21941 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MATN1P21941 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MATN1P21941 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MATN1P21941 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MATN1P21941 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MATN1P21941 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN1P21941 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN1P21941 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN1P21941 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN1P21941 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN1P21941 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN1P21941 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN1P21941 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN1P21941 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN1P21941 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN1P21941 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MATN1P21941 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MATN1P21941 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MATN1P21941 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MATN1P21941 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MATN1P21941 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MATN1P21941 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MATN1P21941 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MATN1P21941 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MATN1P21941 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MATN1P21941 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MATN1P21941 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MATN1P21941 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MATN1P21941 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MATN1P21941 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MATN1P21941 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MATN1P21941 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MATN1P21941 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MATN1P21941 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MATN1P21941 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MATN1P21941 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MATN1P21941 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MATN1P21941 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MATN1P21941 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN1P21941 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN1P21941 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN1P21941 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN1P21941 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN1P21941 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN1P21941 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN1P21941 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN1P21941 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN1P21941 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN1P21941 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN1P21941 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN1P21941 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MATN1P21941 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MATN1P21941 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MATN1P21941 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MATN1P21941 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MATN1P21941 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MATN1P21941 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MATN1P21941 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MATN1P21941 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MATN1P21941 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MATN1P21941 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MATN1P21941 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MATN1P21941 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MATN1P21941 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MATN1P21941 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MATN1P21941 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MATN1P21941 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MATN1P21941 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MATN1P21941 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MATN1P21941 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MATN1P21941 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MATN1P21941 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MATN1P21941 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MATN1P21941 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MATN1P21941 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MATN1P21941 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MATN1P21941 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MATN1P21941 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MATN1P21941 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MATN1P21941 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MATN1P21941 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MATN1P21941 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MATN1P21941 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MATN1P21941 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MATN1P21941 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MATN1P21941 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms