Protein–RNA interactions for Protein: P21757

MSR1, Macrophage scavenger receptor types I and II, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSR1P21757 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSR1P21757 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSR1P21757 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSR1P21757 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSR1P21757 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSR1P21757 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSR1P21757 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSR1P21757 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSR1P21757 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSR1P21757 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSR1P21757 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSR1P21757 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MSR1P21757 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSR1P21757 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSR1P21757 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSR1P21757 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSR1P21757 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSR1P21757 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSR1P21757 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSR1P21757 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSR1P21757 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSR1P21757 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MSR1P21757 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSR1P21757 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSR1P21757 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSR1P21757 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSR1P21757 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSR1P21757 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSR1P21757 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSR1P21757 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSR1P21757 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MSR1P21757 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSR1P21757 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSR1P21757 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSR1P21757 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSR1P21757 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSR1P21757 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSR1P21757 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MSR1P21757 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSR1P21757 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSR1P21757 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSR1P21757 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSR1P21757 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSR1P21757 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSR1P21757 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSR1P21757 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSR1P21757 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSR1P21757 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSR1P21757 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSR1P21757 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSR1P21757 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSR1P21757 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSR1P21757 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSR1P21757 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSR1P21757 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSR1P21757 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MSR1P21757 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSR1P21757 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSR1P21757 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MSR1P21757 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MSR1P21757 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MSR1P21757 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MSR1P21757 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSR1P21757 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSR1P21757 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSR1P21757 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSR1P21757 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSR1P21757 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSR1P21757 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSR1P21757 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSR1P21757 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSR1P21757 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSR1P21757 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSR1P21757 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MSR1P21757 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSR1P21757 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSR1P21757 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSR1P21757 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSR1P21757 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSR1P21757 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSR1P21757 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSR1P21757 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSR1P21757 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSR1P21757 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSR1P21757 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSR1P21757 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSR1P21757 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSR1P21757 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSR1P21757 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSR1P21757 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSR1P21757 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSR1P21757 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSR1P21757 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSR1P21757 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSR1P21757 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSR1P21757 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSR1P21757 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSR1P21757 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSR1P21757 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MSR1P21757 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms