Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK11BP21127 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK11BP21127 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK11BP21127 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK11BP21127 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK11BP21127 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK11BP21127 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK11BP21127 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK11BP21127 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK11BP21127 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK11BP21127 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK11BP21127 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK11BP21127 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK11BP21127 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK11BP21127 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK11BP21127 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK11BP21127 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK11BP21127 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK11BP21127 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK11BP21127 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK11BP21127 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK11BP21127 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK11BP21127 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK11BP21127 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK11BP21127 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK11BP21127 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms