Protein–RNA interactions for Protein: P20062

TCN2, Transcobalamin-2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN2P20062 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCN2P20062 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCN2P20062 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCN2P20062 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCN2P20062 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCN2P20062 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCN2P20062 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCN2P20062 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCN2P20062 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCN2P20062 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCN2P20062 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TCN2P20062 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCN2P20062 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TCN2P20062 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TCN2P20062 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TCN2P20062 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCN2P20062 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCN2P20062 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCN2P20062 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCN2P20062 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCN2P20062 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCN2P20062 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCN2P20062 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCN2P20062 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCN2P20062 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCN2P20062 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TCN2P20062 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCN2P20062 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCN2P20062 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCN2P20062 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCN2P20062 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCN2P20062 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCN2P20062 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCN2P20062 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCN2P20062 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCN2P20062 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCN2P20062 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCN2P20062 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCN2P20062 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCN2P20062 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCN2P20062 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCN2P20062 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCN2P20062 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCN2P20062 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCN2P20062 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCN2P20062 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCN2P20062 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCN2P20062 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCN2P20062 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCN2P20062 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCN2P20062 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCN2P20062 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCN2P20062 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCN2P20062 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCN2P20062 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCN2P20062 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TCN2P20062 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCN2P20062 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCN2P20062 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TCN2P20062 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCN2P20062 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCN2P20062 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCN2P20062 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TCN2P20062 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCN2P20062 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCN2P20062 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCN2P20062 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCN2P20062 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCN2P20062 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCN2P20062 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCN2P20062 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCN2P20062 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCN2P20062 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TCN2P20062 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCN2P20062 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCN2P20062 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TCN2P20062 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCN2P20062 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCN2P20062 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCN2P20062 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCN2P20062 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TCN2P20062 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCN2P20062 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCN2P20062 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TCN2P20062 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCN2P20062 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TCN2P20062 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCN2P20062 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCN2P20062 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCN2P20062 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCN2P20062 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCN2P20062 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TCN2P20062 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCN2P20062 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCN2P20062 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCN2P20062 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCN2P20062 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCN2P20062 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCN2P20062 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCN2P20062 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms