Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AMY2BP19961 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AMY2BP19961 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AMY2BP19961 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AMY2BP19961 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AMY2BP19961 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AMY2BP19961 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AMY2BP19961 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AMY2BP19961 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMY2BP19961 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMY2BP19961 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMY2BP19961 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMY2BP19961 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMY2BP19961 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMY2BP19961 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMY2BP19961 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMY2BP19961 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
AMY2BP19961 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AMY2BP19961 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMY2BP19961 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms