Protein–RNA interactions for Protein: P19022

CDH2, Cadherin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH2P19022 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH2P19022 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH2P19022 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH2P19022 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH2P19022 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH2P19022 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH2P19022 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH2P19022 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH2P19022 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH2P19022 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH2P19022 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH2P19022 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH2P19022 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH2P19022 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH2P19022 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH2P19022 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH2P19022 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH2P19022 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH2P19022 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH2P19022 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH2P19022 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH2P19022 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH2P19022 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH2P19022 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH2P19022 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH2P19022 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH2P19022 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH2P19022 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH2P19022 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH2P19022 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH2P19022 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH2P19022 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH2P19022 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH2P19022 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH2P19022 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH2P19022 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH2P19022 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH2P19022 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH2P19022 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH2P19022 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH2P19022 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH2P19022 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH2P19022 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CDH2P19022 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDH2P19022 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH2P19022 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH2P19022 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH2P19022 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH2P19022 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH2P19022 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH2P19022 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH2P19022 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH2P19022 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH2P19022 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH2P19022 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH2P19022 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH2P19022 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH2P19022 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH2P19022 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH2P19022 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH2P19022 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH2P19022 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH2P19022 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH2P19022 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH2P19022 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH2P19022 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH2P19022 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH2P19022 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH2P19022 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH2P19022 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH2P19022 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH2P19022 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH2P19022 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH2P19022 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH2P19022 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH2P19022 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH2P19022 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH2P19022 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH2P19022 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH2P19022 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH2P19022 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH2P19022 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH2P19022 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH2P19022 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH2P19022 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH2P19022 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH2P19022 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH2P19022 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH2P19022 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH2P19022 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH2P19022 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH2P19022 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH2P19022 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH2P19022 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH2P19022 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH2P19022 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH2P19022 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH2P19022 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH2P19022 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH2P19022 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms