Protein–RNA interactions for Protein: P17858

PFKL, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKLP17858 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PFKLP17858 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PFKLP17858 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PFKLP17858 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PFKLP17858 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PFKLP17858 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PFKLP17858 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PFKLP17858 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PFKLP17858 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PFKLP17858 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PFKLP17858 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PFKLP17858 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PFKLP17858 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PFKLP17858 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PFKLP17858 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PFKLP17858 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PFKLP17858 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PFKLP17858 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PFKLP17858 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PFKLP17858 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PFKLP17858 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PFKLP17858 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PFKLP17858 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PFKLP17858 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PFKLP17858 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PFKLP17858 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PFKLP17858 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PFKLP17858 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PFKLP17858 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PFKLP17858 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PFKLP17858 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PFKLP17858 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PFKLP17858 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PFKLP17858 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PFKLP17858 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PFKLP17858 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PFKLP17858 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PFKLP17858 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PFKLP17858 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PFKLP17858 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PFKLP17858 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PFKLP17858 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PFKLP17858 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PFKLP17858 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PFKLP17858 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PFKLP17858 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PFKLP17858 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PFKLP17858 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PFKLP17858 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PFKLP17858 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PFKLP17858 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PFKLP17858 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PFKLP17858 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PFKLP17858 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PFKLP17858 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PFKLP17858 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PFKLP17858 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PFKLP17858 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PFKLP17858 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PFKLP17858 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PFKLP17858 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PFKLP17858 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PFKLP17858 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PFKLP17858 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PFKLP17858 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PFKLP17858 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PFKLP17858 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PFKLP17858 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PFKLP17858 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PFKLP17858 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PFKLP17858 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PFKLP17858 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PFKLP17858 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PFKLP17858 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PFKLP17858 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PFKLP17858 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PFKLP17858 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PFKLP17858 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PFKLP17858 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PFKLP17858 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PFKLP17858 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PFKLP17858 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PFKLP17858 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PFKLP17858 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PFKLP17858 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PFKLP17858 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PFKLP17858 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PFKLP17858 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PFKLP17858 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PFKLP17858 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PFKLP17858 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PFKLP17858 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PFKLP17858 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PFKLP17858 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PFKLP17858 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PFKLP17858 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PFKLP17858 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PFKLP17858 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PFKLP17858 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PFKLP17858 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms