Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPN2P17655 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPN2P17655 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPN2P17655 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPN2P17655 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPN2P17655 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPN2P17655 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPN2P17655 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAPN2P17655 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CAPN2P17655 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAPN2P17655 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAPN2P17655 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CAPN2P17655 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CAPN2P17655 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CAPN2P17655 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPN2P17655 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPN2P17655 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPN2P17655 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPN2P17655 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPN2P17655 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPN2P17655 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPN2P17655 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPN2P17655 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPN2P17655 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPN2P17655 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPN2P17655 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAPN2P17655 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAPN2P17655 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPN2P17655 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPN2P17655 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPN2P17655 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPN2P17655 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPN2P17655 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPN2P17655 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPN2P17655 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPN2P17655 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPN2P17655 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPN2P17655 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPN2P17655 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPN2P17655 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPN2P17655 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CAPN2P17655 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CAPN2P17655 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAPN2P17655 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAPN2P17655 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAPN2P17655 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAPN2P17655 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN2P17655 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN2P17655 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN2P17655 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN2P17655 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPN2P17655 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPN2P17655 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPN2P17655 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPN2P17655 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPN2P17655 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPN2P17655 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPN2P17655 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPN2P17655 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPN2P17655 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPN2P17655 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPN2P17655 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPN2P17655 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPN2P17655 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms