Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMPD1P17405 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMPD1P17405 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SMPD1P17405 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMPD1P17405 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMPD1P17405 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMPD1P17405 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SMPD1P17405 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMPD1P17405 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMPD1P17405 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SMPD1P17405 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMPD1P17405 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SMPD1P17405 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SMPD1P17405 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMPD1P17405 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMPD1P17405 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMPD1P17405 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMPD1P17405 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMPD1P17405 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMPD1P17405 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SMPD1P17405 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMPD1P17405 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMPD1P17405 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMPD1P17405 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms