Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UCHL3P15374 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UCHL3P15374 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UCHL3P15374 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UCHL3P15374 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UCHL3P15374 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UCHL3P15374 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UCHL3P15374 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UCHL3P15374 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
UCHL3P15374 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UCHL3P15374 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UCHL3P15374 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UCHL3P15374 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UCHL3P15374 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UCHL3P15374 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UCHL3P15374 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UCHL3P15374 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UCHL3P15374 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UCHL3P15374 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UCHL3P15374 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UCHL3P15374 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UCHL3P15374 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UCHL3P15374 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UCHL3P15374 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UCHL3P15374 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UCHL3P15374 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UCHL3P15374 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UCHL3P15374 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UCHL3P15374 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UCHL3P15374 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UCHL3P15374 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms