Protein–RNA interactions for Protein: P14652

HOXB2, Homeobox protein Hox-B2, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2P14652 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXB2P14652 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB2P14652 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXB2P14652 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB2P14652 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB2P14652 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB2P14652 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB2P14652 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB2P14652 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB2P14652 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB2P14652 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB2P14652 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB2P14652 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB2P14652 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB2P14652 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB2P14652 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB2P14652 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB2P14652 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXB2P14652 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXB2P14652 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXB2P14652 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms