Protein–RNA interactions for Protein: P13591

NCAM1, Neural cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAM1P13591 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCAM1P13591 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAM1P13591 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCAM1P13591 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCAM1P13591 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms