Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK4P11802 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK4P11802 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK4P11802 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK4P11802 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK4P11802 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK4P11802 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK4P11802 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK4P11802 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK4P11802 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDK4P11802 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDK4P11802 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK4P11802 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK4P11802 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK4P11802 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK4P11802 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK4P11802 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK4P11802 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK4P11802 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK4P11802 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK4P11802 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK4P11802 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK4P11802 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK4P11802 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK4P11802 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK4P11802 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK4P11802 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK4P11802 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK4P11802 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK4P11802 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK4P11802 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK4P11802 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK4P11802 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK4P11802 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK4P11802 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK4P11802 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK4P11802 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK4P11802 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK4P11802 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK4P11802 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK4P11802 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK4P11802 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK4P11802 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK4P11802 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK4P11802 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK4P11802 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK4P11802 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK4P11802 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK4P11802 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK4P11802 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK4P11802 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK4P11802 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK4P11802 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK4P11802 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK4P11802 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK4P11802 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK4P11802 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK4P11802 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK4P11802 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK4P11802 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK4P11802 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK4P11802 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK4P11802 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK4P11802 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK4P11802 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK4P11802 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK4P11802 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK4P11802 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK4P11802 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK4P11802 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK4P11802 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK4P11802 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK4P11802 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK4P11802 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK4P11802 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK4P11802 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK4P11802 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK4P11802 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK4P11802 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK4P11802 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDK4P11802 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK4P11802 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK4P11802 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK4P11802 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK4P11802 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK4P11802 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK4P11802 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK4P11802 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK4P11802 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK4P11802 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK4P11802 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK4P11802 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK4P11802 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK4P11802 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK4P11802 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK4P11802 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK4P11802 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK4P11802 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK4P11802 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK4P11802 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms