Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CETPP11597 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CETPP11597 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CETPP11597 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CETPP11597 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CETPP11597 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CETPP11597 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CETPP11597 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CETPP11597 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CETPP11597 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CETPP11597 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CETPP11597 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CETPP11597 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CETPP11597 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CETPP11597 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CETPP11597 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CETPP11597 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CETPP11597 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CETPP11597 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CETPP11597 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CETPP11597 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CETPP11597 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CETPP11597 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CETPP11597 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CETPP11597 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CETPP11597 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CETPP11597 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CETPP11597 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CETPP11597 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CETPP11597 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CETPP11597 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CETPP11597 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CETPP11597 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CETPP11597 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CETPP11597 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CETPP11597 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CETPP11597 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CETPP11597 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CETPP11597 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CETPP11597 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CETPP11597 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CETPP11597 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CETPP11597 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CETPP11597 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CETPP11597 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CETPP11597 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CETPP11597 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CETPP11597 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CETPP11597 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CETPP11597 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CETPP11597 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CETPP11597 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CETPP11597 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CETPP11597 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CETPP11597 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CETPP11597 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CETPP11597 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CETPP11597 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CETPP11597 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CETPP11597 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CETPP11597 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CETPP11597 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CETPP11597 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CETPP11597 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CETPP11597 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CETPP11597 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CETPP11597 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CETPP11597 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CETPP11597 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CETPP11597 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CETPP11597 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CETPP11597 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CETPP11597 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CETPP11597 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CETPP11597 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CETPP11597 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CETPP11597 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CETPP11597 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CETPP11597 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CETPP11597 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CETPP11597 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CETPP11597 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CETPP11597 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CETPP11597 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CETPP11597 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CETPP11597 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CETPP11597 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CETPP11597 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CETPP11597 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CETPP11597 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CETPP11597 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CETPP11597 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CETPP11597 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CETPP11597 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CETPP11597 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CETPP11597 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CETPP11597 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CETPP11597 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CETPP11597 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CETPP11597 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms