Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOP1P11387 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOP1P11387 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP1P11387 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP1P11387 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP1P11387 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP1P11387 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP1P11387 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP1P11387 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP1P11387 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP1P11387 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP1P11387 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP1P11387 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOP1P11387 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP1P11387 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP1P11387 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP1P11387 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP1P11387 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP1P11387 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP1P11387 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOP1P11387 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP1P11387 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP1P11387 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP1P11387 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TOP1P11387 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOP1P11387 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOP1P11387 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOP1P11387 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOP1P11387 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOP1P11387 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOP1P11387 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOP1P11387 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOP1P11387 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOP1P11387 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TOP1P11387 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOP1P11387 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOP1P11387 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TOP1P11387 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOP1P11387 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOP1P11387 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TOP1P11387 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOP1P11387 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOP1P11387 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOP1P11387 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP1P11387 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP1P11387 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP1P11387 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP1P11387 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP1P11387 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP1P11387 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP1P11387 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP1P11387 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP1P11387 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOP1P11387 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP1P11387 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP1P11387 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP1P11387 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOP1P11387 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP1P11387 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP1P11387 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP1P11387 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP1P11387 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOP1P11387 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP1P11387 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP1P11387 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP1P11387 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP1P11387 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP1P11387 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP1P11387 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP1P11387 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP1P11387 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP1P11387 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP1P11387 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOP1P11387 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP1P11387 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP1P11387 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP1P11387 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TOP1P11387 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP1P11387 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP1P11387 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP1P11387 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP1P11387 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP1P11387 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOP1P11387 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP1P11387 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP1P11387 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP1P11387 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP1P11387 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP1P11387 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP1P11387 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP1P11387 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP1P11387 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP1P11387 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP1P11387 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP1P11387 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOP1P11387 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOP1P11387 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TOP1P11387 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TOP1P11387 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP1P11387 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1656.2 ms