Protein–RNA interactions for Protein: P10600

TGFB3, Transforming growth factor beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3P10600 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TGFB3P10600 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TGFB3P10600 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TGFB3P10600 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TGFB3P10600 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TGFB3P10600 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TGFB3P10600 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TGFB3P10600 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TGFB3P10600 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TGFB3P10600 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TGFB3P10600 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TGFB3P10600 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TGFB3P10600 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TGFB3P10600 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TGFB3P10600 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TGFB3P10600 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TGFB3P10600 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TGFB3P10600 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TGFB3P10600 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TGFB3P10600 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TGFB3P10600 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TGFB3P10600 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TGFB3P10600 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TGFB3P10600 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TGFB3P10600 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TGFB3P10600 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TGFB3P10600 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TGFB3P10600 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TGFB3P10600 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TGFB3P10600 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TGFB3P10600 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TGFB3P10600 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TGFB3P10600 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TGFB3P10600 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TGFB3P10600 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TGFB3P10600 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TGFB3P10600 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TGFB3P10600 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TGFB3P10600 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TGFB3P10600 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TGFB3P10600 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TGFB3P10600 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TGFB3P10600 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TGFB3P10600 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms