Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL3P10147 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL3P10147 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL3P10147 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL3P10147 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL3P10147 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL3P10147 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL3P10147 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL3P10147 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL3P10147 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL3P10147 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL3P10147 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL3P10147 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL3P10147 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL3P10147 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL3P10147 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL3P10147 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL3P10147 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL3P10147 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL3P10147 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL3P10147 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL3P10147 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL3P10147 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL3P10147 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL3P10147 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL3P10147 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL3P10147 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL3P10147 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL3P10147 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL3P10147 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL3P10147 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL3P10147 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL3P10147 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL3P10147 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL3P10147 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL3P10147 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL3P10147 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL3P10147 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL3P10147 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL3P10147 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL3P10147 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL3P10147 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL3P10147 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL3P10147 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL3P10147 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL3P10147 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL3P10147 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL3P10147 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL3P10147 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL3P10147 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL3P10147 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL3P10147 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL3P10147 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL3P10147 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL3P10147 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL3P10147 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL3P10147 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL3P10147 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL3P10147 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL3P10147 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL3P10147 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL3P10147 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL3P10147 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL3P10147 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL3P10147 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL3P10147 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL3P10147 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL3P10147 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL3P10147 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL3P10147 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL3P10147 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL3P10147 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL3P10147 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL3P10147 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL3P10147 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL3P10147 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL3P10147 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL3P10147 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCL3P10147 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL3P10147 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL3P10147 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL3P10147 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL3P10147 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL3P10147 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL3P10147 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCL3P10147 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL3P10147 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL3P10147 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL3P10147 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL3P10147 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL3P10147 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL3P10147 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCL3P10147 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCL3P10147 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL3P10147 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL3P10147 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL3P10147 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL3P10147 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCL3P10147 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL3P10147 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms