Protein–RNA interactions for Protein: P09630

HOXC6, Homeobox protein Hox-C6, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6P09630 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXC6P09630 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXC6P09630 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXC6P09630 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXC6P09630 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXC6P09630 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXC6P09630 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXC6P09630 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC6P09630 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC6P09630 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC6P09630 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC6P09630 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXC6P09630 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXC6P09630 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXC6P09630 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXC6P09630 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXC6P09630 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXC6P09630 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXC6P09630 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXC6P09630 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXC6P09630 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXC6P09630 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXC6P09630 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXC6P09630 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXC6P09630 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXC6P09630 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXC6P09630 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXC6P09630 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXC6P09630 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXC6P09630 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXC6P09630 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXC6P09630 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXC6P09630 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXC6P09630 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXC6P09630 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
HOXC6P09630 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXC6P09630 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXC6P09630 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXC6P09630 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXC6P09630 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXC6P09630 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXC6P09630 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXC6P09630 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXC6P09630 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXC6P09630 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXC6P09630 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXC6P09630 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXC6P09630 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXC6P09630 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXC6P09630 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXC6P09630 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXC6P09630 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXC6P09630 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXC6P09630 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXC6P09630 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXC6P09630 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXC6P09630 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXC6P09630 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXC6P09630 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXC6P09630 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms