Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPSAP08865 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPSAP08865 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPSAP08865 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPSAP08865 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPSAP08865 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPSAP08865 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPSAP08865 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPSAP08865 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPSAP08865 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RPSAP08865 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPSAP08865 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPSAP08865 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPSAP08865 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPSAP08865 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RPSAP08865 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPSAP08865 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPSAP08865 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPSAP08865 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPSAP08865 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPSAP08865 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPSAP08865 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPSAP08865 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPSAP08865 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPSAP08865 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPSAP08865 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPSAP08865 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPSAP08865 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPSAP08865 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPSAP08865 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPSAP08865 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPSAP08865 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPSAP08865 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPSAP08865 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPSAP08865 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPSAP08865 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPSAP08865 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RPSAP08865 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPSAP08865 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPSAP08865 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPSAP08865 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPSAP08865 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPSAP08865 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPSAP08865 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPSAP08865 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPSAP08865 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPSAP08865 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPSAP08865 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPSAP08865 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPSAP08865 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPSAP08865 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPSAP08865 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPSAP08865 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPSAP08865 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPSAP08865 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPSAP08865 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPSAP08865 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPSAP08865 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPSAP08865 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPSAP08865 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPSAP08865 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPSAP08865 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPSAP08865 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPSAP08865 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPSAP08865 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPSAP08865 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPSAP08865 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RPSAP08865 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPSAP08865 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPSAP08865 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPSAP08865 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RPSAP08865 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPSAP08865 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPSAP08865 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPSAP08865 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPSAP08865 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPSAP08865 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPSAP08865 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPSAP08865 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPSAP08865 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPSAP08865 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPSAP08865 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPSAP08865 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPSAP08865 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPSAP08865 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPSAP08865 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPSAP08865 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPSAP08865 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPSAP08865 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPSAP08865 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPSAP08865 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPSAP08865 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPSAP08865 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPSAP08865 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPSAP08865 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPSAP08865 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPSAP08865 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPSAP08865 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPSAP08865 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPSAP08865 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms