Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TPM2P07951 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TPM2P07951 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TPM2P07951 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TPM2P07951 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TPM2P07951 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TPM2P07951 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TPM2P07951 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TPM2P07951 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TPM2P07951 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TPM2P07951 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TPM2P07951 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TPM2P07951 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TPM2P07951 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TPM2P07951 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TPM2P07951 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TPM2P07951 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TPM2P07951 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TPM2P07951 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TPM2P07951 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TPM2P07951 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TPM2P07951 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TPM2P07951 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TPM2P07951 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TPM2P07951 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TPM2P07951 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TPM2P07951 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TPM2P07951 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TPM2P07951 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TPM2P07951 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TPM2P07951 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TPM2P07951 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TPM2P07951 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TPM2P07951 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TPM2P07951 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TPM2P07951 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TPM2P07951 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TPM2P07951 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TPM2P07951 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TPM2P07951 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TPM2P07951 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TPM2P07951 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TPM2P07951 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TPM2P07951 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TPM2P07951 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TPM2P07951 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TPM2P07951 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TPM2P07951 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TPM2P07951 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TPM2P07951 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TPM2P07951 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPM2P07951 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPM2P07951 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPM2P07951 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPM2P07951 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPM2P07951 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPM2P07951 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPM2P07951 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPM2P07951 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPM2P07951 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPM2P07951 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TPM2P07951 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TPM2P07951 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TPM2P07951 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TPM2P07951 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TPM2P07951 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TPM2P07951 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TPM2P07951 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TPM2P07951 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TPM2P07951 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TPM2P07951 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TPM2P07951 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TPM2P07951 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TPM2P07951 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TPM2P07951 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TPM2P07951 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TPM2P07951 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TPM2P07951 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TPM2P07951 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TPM2P07951 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TPM2P07951 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TPM2P07951 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TPM2P07951 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TPM2P07951 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TPM2P07951 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TPM2P07951 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TPM2P07951 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TPM2P07951 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TPM2P07951 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TPM2P07951 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TPM2P07951 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPM2P07951 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPM2P07951 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPM2P07951 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPM2P07951 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPM2P07951 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPM2P07951 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TPM2P07951 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TPM2P07951 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TPM2P07951 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms