Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLK3P07288 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLK3P07288 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KLK3P07288 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLK3P07288 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLK3P07288 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLK3P07288 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLK3P07288 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLK3P07288 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLK3P07288 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLK3P07288 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLK3P07288 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLK3P07288 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLK3P07288 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLK3P07288 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLK3P07288 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLK3P07288 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLK3P07288 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLK3P07288 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLK3P07288 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLK3P07288 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KLK3P07288 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLK3P07288 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLK3P07288 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLK3P07288 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLK3P07288 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLK3P07288 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLK3P07288 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLK3P07288 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLK3P07288 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLK3P07288 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLK3P07288 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLK3P07288 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLK3P07288 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLK3P07288 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLK3P07288 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KLK3P07288 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KLK3P07288 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLK3P07288 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLK3P07288 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLK3P07288 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLK3P07288 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLK3P07288 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLK3P07288 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLK3P07288 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLK3P07288 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLK3P07288 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLK3P07288 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLK3P07288 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLK3P07288 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLK3P07288 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLK3P07288 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLK3P07288 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLK3P07288 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KLK3P07288 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLK3P07288 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLK3P07288 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLK3P07288 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLK3P07288 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLK3P07288 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLK3P07288 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLK3P07288 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLK3P07288 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLK3P07288 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLK3P07288 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLK3P07288 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLK3P07288 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLK3P07288 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLK3P07288 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLK3P07288 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLK3P07288 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLK3P07288 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KLK3P07288 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLK3P07288 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLK3P07288 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLK3P07288 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLK3P07288 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLK3P07288 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLK3P07288 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLK3P07288 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLK3P07288 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLK3P07288 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLK3P07288 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLK3P07288 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLK3P07288 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLK3P07288 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLK3P07288 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLK3P07288 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KLK3P07288 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KLK3P07288 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KLK3P07288 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLK3P07288 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLK3P07288 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLK3P07288 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLK3P07288 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLK3P07288 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLK3P07288 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLK3P07288 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KLK3P07288 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KLK3P07288 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms