Protein–RNA interactions for Protein: P06732

CKM, Creatine kinase M-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMP06732 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKMP06732 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKMP06732 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKMP06732 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKMP06732 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKMP06732 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKMP06732 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CKMP06732 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKMP06732 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CKMP06732 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CKMP06732 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CKMP06732 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CKMP06732 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CKMP06732 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CKMP06732 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKMP06732 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKMP06732 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKMP06732 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKMP06732 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKMP06732 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CKMP06732 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CKMP06732 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CKMP06732 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CKMP06732 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CKMP06732 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CKMP06732 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CKMP06732 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CKMP06732 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CKMP06732 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CKMP06732 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CKMP06732 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CKMP06732 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CKMP06732 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CKMP06732 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CKMP06732 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CKMP06732 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CKMP06732 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CKMP06732 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CKMP06732 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CKMP06732 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CKMP06732 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CKMP06732 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CKMP06732 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CKMP06732 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CKMP06732 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CKMP06732 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CKMP06732 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CKMP06732 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CKMP06732 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CKMP06732 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CKMP06732 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CKMP06732 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CKMP06732 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CKMP06732 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CKMP06732 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CKMP06732 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CKMP06732 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CKMP06732 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CKMP06732 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CKMP06732 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CKMP06732 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CKMP06732 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CKMP06732 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKMP06732 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CKMP06732 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CKMP06732 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CKMP06732 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CKMP06732 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CKMP06732 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CKMP06732 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CKMP06732 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CKMP06732 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CKMP06732 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CKMP06732 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CKMP06732 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CKMP06732 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CKMP06732 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CKMP06732 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CKMP06732 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CKMP06732 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CKMP06732 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CKMP06732 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CKMP06732 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CKMP06732 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CKMP06732 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CKMP06732 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CKMP06732 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CKMP06732 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CKMP06732 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CKMP06732 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CKMP06732 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CKMP06732 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CKMP06732 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CKMP06732 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CKMP06732 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CKMP06732 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CKMP06732 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CKMP06732 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CKMP06732 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CKMP06732 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms