Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLR3DP05423 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLR3DP05423 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
POLR3DP05423 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR3DP05423 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR3DP05423 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR3DP05423 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR3DP05423 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR3DP05423 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR3DP05423 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLR3DP05423 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR3DP05423 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLR3DP05423 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLR3DP05423 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLR3DP05423 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLR3DP05423 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLR3DP05423 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLR3DP05423 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLR3DP05423 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLR3DP05423 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
POLR3DP05423 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLR3DP05423 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLR3DP05423 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLR3DP05423 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLR3DP05423 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
POLR3DP05423 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
POLR3DP05423 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLR3DP05423 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLR3DP05423 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLR3DP05423 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLR3DP05423 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLR3DP05423 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLR3DP05423 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLR3DP05423 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLR3DP05423 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLR3DP05423 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR3DP05423 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR3DP05423 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLR3DP05423 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR3DP05423 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR3DP05423 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR3DP05423 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLR3DP05423 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLR3DP05423 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLR3DP05423 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLR3DP05423 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLR3DP05423 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLR3DP05423 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
POLR3DP05423 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLR3DP05423 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR3DP05423 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POLR3DP05423 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLR3DP05423 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLR3DP05423 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLR3DP05423 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLR3DP05423 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POLR3DP05423 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLR3DP05423 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms