Protein–RNA interactions for Protein: P01037

CST1, Cystatin-SN, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST1P01037 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CST1P01037 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CST1P01037 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CST1P01037 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CST1P01037 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CST1P01037 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CST1P01037 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CST1P01037 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CST1P01037 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CST1P01037 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CST1P01037 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CST1P01037 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CST1P01037 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CST1P01037 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CST1P01037 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CST1P01037 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CST1P01037 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CST1P01037 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CST1P01037 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CST1P01037 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CST1P01037 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CST1P01037 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CST1P01037 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CST1P01037 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CST1P01037 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CST1P01037 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CST1P01037 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CST1P01037 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CST1P01037 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CST1P01037 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CST1P01037 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CST1P01037 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CST1P01037 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CST1P01037 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CST1P01037 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CST1P01037 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CST1P01037 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CST1P01037 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CST1P01037 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CST1P01037 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CST1P01037 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CST1P01037 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CST1P01037 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CST1P01037 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CST1P01037 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CST1P01037 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CST1P01037 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CST1P01037 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CST1P01037 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CST1P01037 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CST1P01037 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CST1P01037 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CST1P01037 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CST1P01037 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CST1P01037 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CST1P01037 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CST1P01037 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CST1P01037 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CST1P01037 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CST1P01037 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CST1P01037 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CST1P01037 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CST1P01037 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CST1P01037 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CST1P01037 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CST1P01037 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CST1P01037 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CST1P01037 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CST1P01037 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CST1P01037 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CST1P01037 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CST1P01037 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CST1P01037 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CST1P01037 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CST1P01037 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CST1P01037 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CST1P01037 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CST1P01037 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CST1P01037 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CST1P01037 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CST1P01037 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CST1P01037 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CST1P01037 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CST1P01037 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CST1P01037 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CST1P01037 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CST1P01037 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CST1P01037 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CST1P01037 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CST1P01037 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CST1P01037 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CST1P01037 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CST1P01037 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CST1P01037 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CST1P01037 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CST1P01037 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CST1P01037 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CST1P01037 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CST1P01037 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CST1P01037 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms