Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MBD3O95983 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MBD3O95983 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MBD3O95983 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MBD3O95983 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MBD3O95983 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD3O95983 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD3O95983 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD3O95983 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD3O95983 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD3O95983 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD3O95983 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD3O95983 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD3O95983 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MBD3O95983 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MBD3O95983 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MBD3O95983 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MBD3O95983 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MBD3O95983 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MBD3O95983 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD3O95983 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD3O95983 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD3O95983 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD3O95983 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD3O95983 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD3O95983 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD3O95983 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MBD3O95983 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MBD3O95983 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MBD3O95983 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MBD3O95983 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MBD3O95983 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MBD3O95983 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MBD3O95983 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MBD3O95983 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MBD3O95983 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MBD3O95983 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MBD3O95983 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MBD3O95983 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MBD3O95983 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MBD3O95983 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MBD3O95983 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MBD3O95983 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MBD3O95983 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MBD3O95983 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MBD3O95983 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MBD3O95983 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MBD3O95983 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MBD3O95983 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MBD3O95983 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MBD3O95983 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MBD3O95983 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MBD3O95983 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MBD3O95983 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MBD3O95983 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MBD3O95983 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MBD3O95983 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MBD3O95983 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MBD3O95983 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MBD3O95983 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MBD3O95983 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD3O95983 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD3O95983 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD3O95983 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD3O95983 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD3O95983 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MBD3O95983 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MBD3O95983 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MBD3O95983 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MBD3O95983 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MBD3O95983 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MBD3O95983 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MBD3O95983 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MBD3O95983 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MBD3O95983 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MBD3O95983 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MBD3O95983 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MBD3O95983 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MBD3O95983 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MBD3O95983 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MBD3O95983 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MBD3O95983 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MBD3O95983 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MBD3O95983 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MBD3O95983 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MBD3O95983 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MBD3O95983 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MBD3O95983 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MBD3O95983 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MBD3O95983 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MBD3O95983 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MBD3O95983 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MBD3O95983 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MBD3O95983 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MBD3O95983 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MBD3O95983 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MBD3O95983 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MBD3O95983 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MBD3O95983 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MBD3O95983 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms