Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4FO95754 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4FO95754 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms